信用:澳门赌场圣克鲁斯分校

泛癌症项目的研究结果发表在Nature和附属刊物论文23。

包括在研究人员的国际团队 澳门赌场圣克鲁斯分校基因组研究所 您已经完成了整个癌症基因组迄今为止最全面的研究,显着提高了我们对癌症基本的了解,并建议对性病的诊断和治疗的新方向。

约什 - 斯图尔特
约什 - 斯图尔特
信用:澳门赌场圣克鲁斯分校

涉及来自37个国家,整个基因组的ICGC / TCGA泛癌分析(被称为pcawg或泛癌项目)分析了超过38种不同的肿瘤类型的2.600基因组超过1300名科学家和临床医生,创建的初级一个巨大的资源癌症基因组。这是再发射点为16个工作组研究癌症的发展,因果关系,发展和分类的多个方面。

以往的研究主要集中在基因组编码的1%的蛋白质。泛癌症项目探讨了相当详细的基因组的其余99%,治疗包括重点区域的基因控制开,关。通过类比,如果基因组可以被看作是一个食谱,有活细胞和癌症的过程,使得以改变它,无论规模大小,然后看着在配料表变化,而ESTA新项目也将查找以前的努力改建为这些成分是如何使用的指令。

“这项研究,它提供了最完整的基因组中的所有部分致癌突变的图片日期,是一个巨大的团队科学工作涉及的研究人员遍布全球,说:”指导委员会成员乔希·斯图尔特,生物分子工程的巴斯教授在澳门赌场圣克鲁斯分校。 “在澳门赌场圣克鲁斯分校,我们在系统生物学和RNA的表达优势帮助我们发现连接在基因组中前所未见随着非编码导致癌症的途径。像绘制的地图,这个新的工作创建一个参考和资源,它可以用来解析研究未来的数据和医生可以用它来指导治疗“。

除了对项目的指导委员会服务,斯图尔特领导的一个工作小组专注于生物也就是说网络和途径在肿瘤细胞遗传变化的影响。隶属于UCSC基因组研究所的其他科学家也很重要贡献的项目做了,包括张韶涵布鲁克斯,生物分子工程学助理教授,蕲春朱,在基因组研究所副研究科学家和研究生大卫·卡梅伦阿里汉和soulette。

基因表达

安吉拉·布鲁克斯
安吉拉·布鲁克斯
信用:澳门赌场圣克鲁斯分校

导致共工作组中的变化不容聚焦通过DNA中的序列,以加成是最癌症基因组学研究的焦点测序在癌细胞中的RNA分子揭示基因表达。

“RNA是基因组的输出,所以测序可以帮助我们理解RNA在全基因组序列鉴定的DNA突变,使我们的癌症基因组是如何改变一个更全面的了解,”布鲁克斯解释。 “那我们发现了很多已知的癌症基因的RNA有无改变对于层面上,我们将不仅仅从DNA序列数据回暖。”

泛癌症项目已经提供了一个全面的资源用于癌症基因组学研究,包括原始测序数据的基因组中,癌症基因组分析软件,以及多种交互式网站探索pcawg数据的各个方面。

该项目扩展和分析癌症基因组先进的方法,治疗包括云计算,并运用这些方法CON SUS大型数据集,发现新的知识关于癌症生物学和证实了先前的研究重要的发现。

23篇论文

Nature magazine
泛癌症项目的研究结果发表在Nature和附属刊物论文23。
信用:澳门赌场圣克鲁斯分校

在2月5日在本质及其附属刊物上发表论文23,泛癌的项目报告称:

癌症基因组是有限的,并且可知,但极大地复杂化。通过全基因组癌症的测序提供一套工具分析相结合,科学家可以表征癌症中发现的每个基因变化,即产生有这些突变的所有进程,并在癌症的生命历史的重要事件,甚至顺序。

研究人员已经接近编目所有在巨蟹座所涉及的生物途径并且它们在基因组行动的更全面的了解。至少有一个因果突变,在几乎所有的分析了癌症的发现和流程,是产生突变的发现是巨大的不同,从单个DNA字母整个染色体的重组变化。超过基因组控制基因如何开启和关闭被确定为致癌突变的目标的十几个地区。

一种新的方法可以识别哪些突变发生年,有时甚至几十年,肿瘤出现前。 ESTA打开,从理论上说,对于早期癌症检测的机会之窗。

肿瘤类型能准确识别据看过整个基因组遗传改变的模式,帮助的潜在患者的癌症的临床试验,因为常规的STI无法识别类型的诊断。确切的肿瘤类型的知识可以帮助医生裁缝治疗。

“调查结果今天我们有共享与世界上都是无与伦比的,长达十年之久的合作也探索了整个癌症基因组,大成”医生说。林肯·斯坦,项目指导委员会和肿瘤学头在自适应安大略癌症研究所(RCIW)的成员。 “有了知识,我们已经获得了关于肿瘤的起源和演化,我们可以开发新的工具和治疗方法来检测癌症更早,更成功地开发出更多有针对性的治疗和治疗病人。”

通过在宽范围的肿瘤类型的分析中癌细胞的分子像差,泛癌分析是用于识别共同途径的有力工具导致癌症。司徒过气ESTA方法的先驱,帮助组织的泛癌症倡议 癌症基因组图谱 (TCGA)美国的程序美国国立卫生研究院(NIH)。全基因组的泛癌分析扩大到包括ESTA方法的非编码基因组的区域中,使用从TCGA和全基因组数据的 国际癌症基因组联盟 (ICGC)。

结果提供新的见解癌症和极有价值的一套科学界资源的分子司机提前癌症研究。

“我非常高兴地看到这项工作的结果出来,因为这是盛大这样的挑战,走到一起作为全球科学界和拼凑成一个连贯的这些发现的故事,”斯图尔特说。

所有的文件和相关材料可在网上 www.nature.com/collections/pcawg.